| どる仲 UD関係ログ |
1. Phthalocyanine 2004/11/21(Sun) 10:41:31 タンパク質解析プロジェクトと呼べばいいのかな、新しいプロジェクト・・・ "Human Proteome Folding Project" http://forum.grid.org/phpBB/viewtopic.php?t=15024 （あぞ訳） 新しいプロジェクト"Human Proteome Folding Project"を始めたぜ〜、ヨロシク。詳しくはhttp://www.grid.org/projects/hpfを見てくれよな。プロジェクトの概要とこれで俺たちがナニをしたいのか書いといたからよ。 最初のダウンロードはかなり大きいぜ！覚悟しな！ WorkUnitあたりの予想解析時間は20時間ってところかな。CPU Time（実行時間）が２週間になったらタイムアウトだぜ！（PCの電源落としていても）３週間経てば強制終了さ〜 解析ソフトはRosettaちゃんだ。チェックポイントは１つの構造の解析が終わるたびにあるぜ、がんばれ！Rosettaちゃんはみかけによらず大飯ぐらいだ。RAM 70MB、仮想RAM 300MBだぜ〜。「でかすぎだぜ兄貴〜」ってチキンな野郎は、癌だけにしときな！ そうそう、（IBMが同時に始めた）"World Community Grid"は、"Human Proteome Folding Project"のみの同じプロジェクトだからな。UDなおまえらは乗り換える必要はないぞ。 宿題(WorkUnit)は、時間が経つにつれて小さくなっている模様。UDが最適サイズに少しずつ調整しているようです。ROSETTAちゃん嫌！って人は、My Device Manager→Profiles→Profile Name選択→Human Proteome Folding Projectのチェックを外す→SAVEで。 2. amg 2004/11/21(Sun) 12:02:33 >Human Proteome Folding Project i850,P4-2.4GHz無印(FSB:400)＋メモリ768MB(RDRAM:PC800-45)な環境にて50時間近く掛かりました。 3. kita 2004/11/21(Sun) 13:46:51 Foldingつーのは、蛋白質の「折りたたみ」のことです。 蛋白質はアミノ酸が数珠繋ぎになったものですが、そこから余計な部分が切り出されたり、必要な修飾がおこなわれたり、必要な三次元構造をとってはじめて、機能します。 その三次元構造へといたる過程をfoldingと呼びます。 蛋白質が加熱されると機能を失うことを変性といいますが、それは熱によってこの三次元構造が崩れることを意味しています。 4. さかざき 2004/11/24(Wed) 17:25:31 >Rosettaちゃんはみかけによらず大飯ぐらいだ。 名前からして(ガンスリの影響か？)やってみたいと思いました。 でもうちの環境では苦しいかなあ・・・。 その訳ステキです〜☆ |
